Le conseil de la fédération Nanosats est composé de membres élus et nommés parmi les personnels de ses unités membres.
La composition du conseil est la suivante :
Coralie Neiner (directrice de la fédération, présidente)
Gauthier Hulot (directeur adjoint de la fédération)
Pierre Drossart (membre élu, IAP, Sorbonne Université)
Noël Grand (membre élu, LISA, UPEC)
Sébastien Payan (membre élu, LATMOS, CNRS)
Nicolas Rividi (membre élu, Camparis, Sorbonne Université)
Boris Segret (membre élu, CENSUS, Observatoire de Paris)
Jeanne Treuttel (membre élu, LERMA, Observatoire de Paris)
Claude Catala (membre nommé, LESIA, Observatoire de Paris)
Hubert Halloin (membre nommé, APC, UPCité)
Daniel Hestroffer (membre nommé, IMCCE, Observatoire de Paris)
Nicolas Rambaux (membre nommé, CurieSat, Sorbonne Université)